Математические методы биоинформатики

Специальность: Прикладная математика и информатика и Фундаментальная информатика и информационные технологии

Предметом рассмотрения настоящего курса являются математические методы биоинформатики, которые широко применяются для анализа биомедицинских данных. Цель курса состоит в формировании у студентов базовых знаний в области математических методов биоинформатики (методов преимущественно статистических) и навыков их практической реализации на примере программного пакета R. Особое внимание уделяется формированию у студентов общенаучных навыков формулировки биологических задач на математическом языке и их решению.

В результате освоения дисциплины обучающийся должен:
Знать:
базовые математические методы биоинформатики, условия их применимости.
Уметь:
определять и профессионально реализовывать необходимые для решения прикладных задач биоинформатики математические методы, анализировать полученные результаты.
Владеть:
математическими методами биоинформатики.

Содержание

1. Элементы математической статистики
2. Основы статистического анализа в среде R
3. Статистические методы в биомедицине
4. Построение статистических моделей

Литература

а) основная литература:
1. Кремер Н.Ш. Теория вероятностей и математическая статистика:
Учебник для вузов.– М.: ЮНИТИ – ДАНА, 2006.-573 с.
2. Феллер В. Введение в теорию вероятностей и ее приложения. В 2-х
томах.– М.: Мир, 1984.

б) дополнительная литература:
1. Теория вероятностей и математическая статистика в задачах: Учеб.
пособие для вузов/ В.А. Ватутин, Г.И. Ивченко, Ю.И. Медведев и
др.– М.: Дрофа, 2003. –328 с.
2. Бородовский М., Екишева С., Задачи и решения по анализу биологических последовательностей. - М.-Ижевск: НИЦ "Регуляторная и хаотическая динамика", Институт компьютерных исследований, 2008. - 440 стр.
3. Johnes N., Pevzner P., An introduction to bioinformatics algorithms. – MIT Press, 2004. – 454 p.

в) программное обеспечение и Интернет-ресурсы
1. Программный пакет R http://cran.r-project.org/ .

Отчетность

Семестр 7: Зач