Кириллин Михаил Юрьевич

Кафедра прикладной математики
Доцент
Кандидат физико-математических наук
mikhail.kirillin@itmm.unn.ru

Дела учебные

  • Численные методы в биофотонике

Научная деятельность

Избранные публикации:

Books and book chapters

  1. A.V. Bykov, M.Yu.Kirillin, A.V. Priezzhev, “Monte Carlo simulation of light propagation in human tissues and noninvasive glucose sensing”, Chapter 3 in Handbook of Optical Sensing of Glucose in Biological Fluids and Tissues (Ed. – V.V.Tuchin), CRC Press, Boca Raton, London, New York, Washington, 2008, pp. 67-98.
  2. V. Gelikonov, G. Gelikonov, M. Kirillin, N. Shakhova, A. Sergeev, N. Gladkova, E. Zagaynova “Fiber-Based OCT: From Optical Design to Clinical Applications”, Chapter 16 in Handbook of Photonics for Biomedical Science (Ed. – V.V. Tuchin), CRC Press, Boca Raton, London, New York, Washington, 2010, pp. 423-444.
  3. М.Ю. Кириллин, И.И. Фикс, А.Р. Катичев, А.В. Горшков, В.П. Гергель, “Высокопроизводительные вычисления для задач оптической биомедицинской диагностики” в сборнике «Суперкомпьютерные технологии в науке, образовании и промышленности (третий выпуск)», ред. В.А. Садовничий, Г.И. Савин, Вл.В. Воеводин, М.: Издательство Московского университета, 2012. с. 222-229, ISBN 978-5-211-06345-7.

Publications in international peer-reviewed journals

2021

  1. Perekatova, V., Kirillin, M., Subochev, P., Kurnikov, A., Khilov, A., Orlova, A., ... & Turchin, I. (2021). Quantification of microvasculature parameters based on optoacoustic angiography data. Laser Physics Letters, 18(3), 035602.
  2. Kirillin, M., Kurakina, D., Khilov, A., Orlova, A., Shakhova, M., Orlinskaya, N., & Sergeeva, E. (2021). Red and blue light in antitumor photodynamic therapy with chlorin-based photosensitizers: a comparative animal study assisted by optical imaging modalities. Biomedical Optics Express, 12(2), 872-892.
  3. Luchinin, A. G., & Kirillin, M. Y. (2021). Effect of scattering anisotropy on the properties of photon density waves. Applied Optics, 60(1), 33-40.
  4. Priezzhev, A. V. E., Lugovtsov, A. E., Kirillin, M. Y., & Tuchin, V. V. (2021). Laser biophotonics. Quantum Electronics, 51(1), 1.
  5. Sokolovskaya, O. G. I., Zabotnov, S. V. E., Golovan, L. A. E., Kashkarov, P. K., Kurakina, D. A., Sergeeva, E. A., & Kirillin, M. Y. (2021). Prospects for using silicon nanoparticles fabricated by laser ablation in hyperthermia of tumours. Quantum Electronics, 51(1), 64.

2020

  1. Soloviev, N., Khilov, A., Shakhova, M., Meller, A., Perekatova, V., Sergeeva, E., & Kirillin, M. (2020). Machine learning aided automated differential diagnostics of chronic rhinitis based on optical coherence tomography. Laser Physics Letters, 17(11), 115608.
  2. Zabotnov, S. V., Skobelkina, A. V., Sergeeva, E. A., Kurakina, D. A., Khilov, A. V., Kashaev, F. V., ... & Kirillin, M. Y. (2020). Nanoparticles Produced via Laser Ablation of Porous Silicon and Silicon Nanowires for Optical Bioimaging. Sensors, 20(17), 4874.
  3. Anosov, A. A., Kirillin, M. Y., Orlova, A. G., Erofeev, A. V., Sharakshane, A. S., Shcherbakov, M. I., ... & Subochev, P. V. (2020). Volumetric quantification of skin microcirculation disturbance induced by local compression. Laser Physics Letters, 17(8), 085601.
  4. Luchinin, A. G., Kirillin, M. Y., & Dolin, L. S. (2020). Nonstationary angular distribution of optical field radiance from an isotropic source in sea water. Applied Optics, 59(20), 6046-6053.
  5. Kurakina, D., Khilov, A., Shakhova, M., Orlinskaya, N., Sergeeva, E., Meller, A., ... & Kirillin, M. (2020). Comparative analysis of single-and dual-wavelength photodynamic therapy regimes with chlorin-based photosensitizers: animal study. Journal of biomedical optics, 25(6), 063804.
  6. Subochev, P., Smolina, E., Sergeeva, E., Kirillin, M., Orlova, A., Kurakina, D., ... & Razansky, D. (2020). Toward whole-brain in vivo optoacoustic angiography of rodents: modeling and experimental observations. Biomedical optics express, 11(3), 1477-1488.
  7. Priezzhev, A. V. E., Lugovtsov, A. E., Kirillin, M. Y. E., & Tuchin, V. V. (2020). Topical problems of biophotonics. Kvantovaya Elektronika, 50(1), 1-1.
  8. Zabotnov, S. V. E., Kurakina, D. A., Kashaev, F. V., Skobelkina, A. V., Kolchin, A. V. E., Kaminskaya, T. Y. P., ... & Golovan, L. A. E. (2020). Structural and optical properties of nanoparticles formed by laser ablation of porous silicon in liquids: Perspectives in biophotonics. Quantum Electronics, 50(1), 69.
  9. Zakharkina, O. G. L., Sergeeva, E. A., Kirillin, M. Y., & Ignatieva, N. Y. (2020). Analysis of laser-induced modification of collagen structure using nonlinear optical microscopy. Quantum Electronics, 50(1), 76.

2019

  1. M. Yu. Kirillin, D. A. Kurakina, V. V. Perekatova, A. G. Orlova, E. A. Sergeeva, A. V. Khilov, P. V. Subochev, I. V. Turchin, S. Mallidi, and T. Hasan. Complementary bimodal approach to monitoring of photodynamic therapy with targeted nanoconstructs: numerical simulations. Quantum Electronics 49, no. 1 (2019): 43.
  2. A.V. Priezzhev, V.V. Tuchin, A.E. Lugovtsov, and M.Yu. Kirillin. Laser biophotonics. Kvantovaya Elektronika 49, no. 1 (2019): 1–1.
  3. Хи­лов А. В., Ку­ра­ки­на Д. А., Тур­чин И. В., Ки­рил­лин М. Ю. (2019). Мо­ни­то­ринг ло­ка­ли­за­ции фо­то­сен­си­би­ли­за­то­ров хло­ри­но­во­го ряда с по­мо­щью дву­хвол­но­во­го флу­о­рес­цент­но­го ими­джин­га: чис­лен­ное мо­де­ли­ро­ва­ние. Кван­то­вая элек­тро­ни­ка, 49(1), 63–69.
  4. Ша­хо­ва М. А., Мел­лер А. Е., Со­ло­вьев Н. А., Те­рен­тье­ва А. Б., Ша­хов А. В., Ку­ра­ки­на Д. А., Ки­рил­лин М. Ю. (2019). Диф­фе­рен­ци­аль­ная ди­а­гно­сти­ка раз­лич­ных форм хро­ни­че­ско­го ри­ни­та на ос­но­ве дан­ных оп­ти­че­ской ко­ге­рент­ной то­мо­гра­фии. Рос­сий­ская ри­но­ло­гия, 27(3), 127–133.

2018

  1. Valeriya V. Perekatova, Mikhail Yu Kirillin, Ilya V. Turchin, and Pavel V. Subochev. Combination of virtual point detector concept and fluence compensation in acoustic resolution photoacoustic microscopy. Journal of biomedical optics 23, no. 9 (2018): 091414.
  2. A. V. Khilov, M. Yu Kirillin, D. A. Loginova, and I. V. Turchin. Estimation of chlorin-based photosensitizer penetration depth prior to photodynamic therapy procedure with dual-wavelength fluorescence imaging. Laser Physics Letters 15, no. 12 (2018): 126202.

2017

  1. M. Kirillin, M. Shakhova, A. Meller, D. Sapunov, P. Agrba, A. Khilov, M. Pasukhin, O. Kondratieva, K. Chikalova, T. Motovilova, E. Sergeeva, I. Turchin, and N. Shakhova, Quantitative optical diagnostics in pathology recognition and monitoring of tissue reaction to PDT, Proc. SPIE, 10417, 10417–15 (2017).
  2. A. G. Orlova, M. Yu Kirillin, A. B. Volovetsky, N. Yu Shilyagina, E. A. Sergeeva, G. Yu Golubiatnikov, and I. V. Turchin. Diffuse optical spectroscopy monitoring of oxygen state and hemoglobin concentration during SKBR-3 tumor model growth. Laser Physics Letters 14, no. 1 (2016): 015601.
  3. A. G. Luchinin, and M. Yu Kirillin. Structure of a modulated narrow light beam in seawater: Monte Carlo simulation. Izvestiya, Atmospheric and Oceanic Physics 53, no. 2 (2017): 242-249.

2016

  1. Меллер А.Е., Мотовилова Т.М., Пантелеева О.Г., Кузнецов С.С., Стройкова К.И., Кондратьева О.А., Кириллин М.Ю., Шахова Н.М. “Неинвазивная диагностика неопухолевой патологии с использованием оптической когерентной томографии” Альманах клинической медицины, 203-212 (2016).
  2. P.D. Agrba and M. Yu. Kirillin, “Effect of temperature regime and compression in OCT-imaging of skin”, Photonics and Lasers in Medicine, 5(2), 161-168 (2016). DOI: 10.1515/plm-2015-0044.
  3. D.A. Loginova, E.A. Sergeeva, A.D. Krainov, P.D. Agrba, M.Yu. Kirillin, “Liquid optical phantoms mimicking spectral characteristics of laboratory mouse biotissues”, Quantum Electronics, 46(6), 528–533 (2016).

2015

  1. Е.В. Губарькова, Е.Б. Киселева, М.Ю. Кириллин, Л.Б. Тимофеева, С.С. Кузнецов, Ф.И. Фельдштейн, Н.Д. Гладкова “Количественная оценка поляризационных характеристик атеросклеротических бляшек коронарных артерий на разных стадиях развития” Современные технологии в медицине, 7(4), 39-49 (2015).
  2. A.V. Gorshkov and M.Yu. Kirillin “Acceleration of Monte Carlo simulation of photon migration in complex heterogeneous media using Intel many-integrated Core Architecture”, J. Biomed. Opt, 20(8), 085002 (2015).
  3. M.Yu. Kirillin, E.A. Sergeeva, P.D. Agrba, A.D. Krainov, A.A. Ezhov, D.V. Shuleyko, P.K. Kashkarov, and S.V. Zabotnov, “Laser-ablated silicon nanoparticles: optical properties and perspectives in optical coherence tomography”, Laser Physics, 25, 075604 (2015). doi:10.1088/1054-660X/25/7/075604
  4. E. Kiseleva, M. Kirillin, F. Feldchtein, A. Vitkin, E. Sergeeva, E. Zagaynova, O. Streltzova, B. Shakhov, E. Gubarkova, and N. Gladkova, “Differential diagnosis of human bladder mucosa pathologies in vivo with cross-polarization optical coherence tomography” Biomedical Optics Express, 6(4), 1464-1476 (2015) doi:10.1364/BOE.6.001464.
  5. Пантелеева О.Г., Кузнецова И.А., Качалина О.В., Елисеева Д.Д., Гребенкина Е.В., ГамаюновС.В., Кузнецов С.С., Юнусова Е.Э., Губарькова Е.В., Кириллин М.Ю., Шахова Н.М. «Оптическая когерентная томография как инструмент в репродуктивной гинекологии», Современные технологии в медицине, 7(1), 89-96 (2015)
  6. I.L. Shlivko, M.Yu. Kirillin, E.V. Donchenko, D.O. Ellinsky, O.E. Garanina, M.S. Neznakhina, P.D. Agrba, V.A. Kamensky “Identification of layers in optical coherence tomography of skin: comparative analysis of experimental and Monte Carlo simulated images”, Skin Research and Technology, 21(4), 419-425 (2015). DOI: 10.1111/srt.12209 (2015).

2014

  1. A. Meller, M. Shakhova, Y. Rilkin, A. Novozhilov, M. Kirillin and A. Shakhov “Optical coherence tomography in diagnosing inflammatory diseases of ENT” Photonics and Lasers in Medicine, 3(4), 323–330 (2014). DOI: 10.1515/plm-2014-0025
  2. M. Kirillin, P. Agrba, and V. Kamensky “Mechanical compression in cross-polarization OCT imaging of skin: in vivo study and Monte Carlo simulation”, Photonics and Lasers in Medicine, 3(4), 363–372 (2014). DOI: 10.1515/plm-2014-0015
  3. A.D. Krainov, P.D. Agrba, E.A. Sergeeva, S.V. Zabotnov, M.Yu. Kirillin, “Study of contrasting properties of nanoparticles for optical diffuse spectroscopy problems”, Quantum Electronics 44 (8), 757–762 (2014).
  4. Горшков А.В., Кириллин М.Ю., Гергель В.П. «Улучшенный метод Монте-Карло для моделирования распространения зондирующего излучения в задачах оптической диффузионной спектроскопии», Вестник нижегородского университета им. Н.И. Лобачевского. Математическое моделирование. Оптимальное управление, 1(1) 239-247 (2014).
  5. M.Yu. Kirillin, G. Farhat, E.A. Sergeeva, M.C. Kolios, and A. Vitkin “Speckle statistics in OCT images: Monte Carlo simulations and experimental studies”, Optics Letters, 39(12), 3472-3475 (2014)
  6. R. Su, M. Kirillin, E.W. Chang, E. Sergeeva, S.H. Yun, and L. Mattsson “Perspectives of mid-infrared OCT for inspection and micrometrology of industrial ceramics”, Optics Express, 22(13), 15804-15819 (2014).
  7. П.Д. Агрба, Е.А. Бакшаева, Д.О. Эллинский, И.Л. Шливко, М.Ю. Кириллин “Роль механической компрессии при визуализации кожи человека методом кросс-поляризационной оптической когерентной томографии”, Современные технологии в медицине, 6(1) 75-82 (2014).
  8. V. O. Korhonen, T. S. Myllylä, M.Yu. Kirillin, A. Popov, A. Bykov, A.V. Gorshkov, E.A. Sergeeva, M. Kinnunen, V. Kiviniemi, “Light propagation in near-infrared spectroscopy of the human brain”, IEEE Journal of Selected Topics in Quantum Electronics, 20(2), 7100310 (2014).
  9. I.L. Shlivko, V.A. Kamensky, M.Yu. Kirillin, P.D.Agrba, O. E. Garanina, M.S. Neznakhina, D.O. Ellinsky, A.S. Maksimova, and Е.V. Donchenko, “Noninvasive study of structural and functional features of neonatal skin”, Journal of Innovative Optical Health Sciences, 7(3), 1450006 (2014).

2013

  1. Е.В. Губарькова, М.Ю. Кириллин, Е.А. Сергеева, Киселева Е.Б., Снопова Л. Б., Проданец Н.Н., Шарабрин Е.Г., Шахов Е.Б., Немирова С.В., Гладкова Н.Д., “Кросс-поляризационная оптическая когерентная томография в оценке структуры атеросклеротической бляшки”, Современные технологии в медицине, 5(4), 24-34 (2013)
  2. А.Д. Крайнов, А.М. Мокеева, Е.А Сергеева, П.Д. Агрба, М.Ю. Кириллин, «Оптические свойства биотканей мыши и их оптических фантомов», Оптика и спектроскопия, 115(2), 47-54 (2013).
  3. Пантелеева О.Г., Зиновьев А.Н., Юнусова К.Э., Кириллин М.Ю. и Шахова Н.М. “Диагностические возможности оптической интроскопии в выявлении причин нарушения репродуктивного здоровья женщин”, Российский вестник акушера-гинеколога , 5, 53-57 (2013).

2012

  1. A.V. Gorshkov, M.Yu. Kirillin, “Monte Carlo simulation of brain sensing by optical diffuse spectroscopy”, Journal of Computational Science, 3, 498–503 (2012).
  2. R. Su, M. Kirillin, P. Ekberg, A. Roos, E. Sergeeva, L. Mattsson “Optical coherence tomography for quality assessment of embedded microchannels in alumina ceramic”, Optics Express, 20(4), 4603-4618 (2012).
  3. M. Kirillin, O. Panteleeva, E. Yunusova, E. Donchenko, and N. Shakhova “Criteria for pathology recognition in OCT of fallopian tubes“, Journal of Biomedical Optics, 17, 081413 (2012).
  4. О.Г. Пантелеева, Б.Е. Шахов, К.Э Юнусова, М.Ю. Кириллин и Н.М. Шахова «Оптическая интроскопия - новый метод диагностики в репродуктивной медицине», Вестник радиологии и рентгенологии, 4, 50-55 (2012)

2011

  1. M.A. Sirotkina, M.V. Shirmanova, M.L.Bugrova, V.V. Elagin, .P.D. Agrba, M.Yu. Kirillin, V.A. Kamensky, E.V. Zagaynova, “Continuous optical coherence tomography monitoring of nanoparticles accumulation in biological tissues”, Journal of Nanoparticle Research, 13(1), 283-291 (2011).
  2. И.И. Фикс, М.Ю. Кириллин, Е.А. Сергеева, И.В. Турчин, «Реконструкция положения объектов для диффузионной флуоресцентной томографии на основе гибридных моделей рассеяния света в биотканях», Известия ВУЗов. Радиофизика, 54(3), 219-233 (2011).

2010

  1. Е.А. Сергеева, А.Р. Катичев, М.Ю. Кириллин, “Формирование сигнала двухфотонной флуоресцентной микроскопии в условиях сильного рассеяния: теоретическое и численное моделирование”, Квантовая Электроника, 40(12), 1053–1061 (2010).
  2. Х.С.С. Сорвойя, Т.С. Мюллюля, М.Ю. Кириллин, Е.А. Сергеева, Р.А. Мюллюля, А.А. Элесуд, Ю. Никкинен, О. Тервонен, В. Кивиниеми, “Неинвазивный МРТ-совместимый волоконно-оптический прибор для функциональной рефлектометрии мозга человека в оптическом и ближнем ИК диапазонах”, Квантовая Электроника, 40(12), 1067-1073 (2010).
  3. M. Kirillin, I. Meglinski, V. Kuzmin, E. Sergeeva and R. Myllylä “Simulation of optical coherence tomography images by Monte Carlo modeling based on polarization vector approach”, Optics Express, 18(21), 21714-21724 (2010).
  4. M.Yu. Kirillin, P.D. Agrba and V.A. Kamensky “In vivo study of the effect of mechanical compression on formation of OCT images of human skin”, Journal of Biophotonics, 3(12), 752-758 (2010).
  5. М.Ю. Кириллин, П.Д. Агрба, М.А. Сироткина, М.В. Ширманова, Е.В. Загайнова, В.А. Каменский “Контрастирование структурных элементов кожи наночастицами в оптической когерентной томографии: количественная оценка”, Квантовая Электроника, 40(6), 525–530 (2010).

2009

  1. П.Д. Агрба, М.Ю. Кириллин, А.И. Абелевич, Е.В. Загайнова, В.А. Каменский, «Компрессия как метод повышения информативности оптической когерентной томографии биотканей», Оптика и спектроскопия, 107(6), 901-906 (2009).
  2. M.Yu. Kirillin, M.V. Shirmanova, M.A. Sirotkina, M.L. Bugrova, B.N. Khlebtsov and E.V. Zagaynova, “Contrasting properties of gold nanoshells and titanium dioxide nanoparticles for OCT imaging of skin: Monte Carlo simulations and in vivo study”, J.Biomed. Opt., 14, 021017 (2009).

2008

  1. I. Meglinski, M. Kirillin, V. Kuzmin and R. Myllylä, “Simulation of Polarization-Sensitive Optical Coherence Tomography images by Monte Carlo method”, Optics Letters, 33(14), 1581-1583 (2008).
  2. E.V. Zagaynova, M.V. Shirmanova, M.Yu. Kirillin, B.N. Khlebtsov, A.G. Orlova, I.V. Balalaeva, M.A. Sirotkina, M.L Bugrova, P.D. Agrba and V.A. Kamensky, “Contrasting properties of gold nanoparticles for optical coherence tomography: phantom, in vivo studies and Monte Carlo simulation”, Phys. Med. Biol., 53, 4995-5009 (2008).
  3. М.Ю. Кириллин, А.В. Быков, А.В. Приезжев, Р. Мюллюля «Использование временного стробирования при измерении уровня глюкозы в трехслойной модели биоткани с помощью сверхкоротких лазерных импульсов», Квантовая Электроника, 38(5), 486-490 (2008).
  4. М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, Р. Мюллюля ”Роль многократного рассеяния при формировании ОКТ изображений кожи”, Квантовая Электроника, 38(6), 570-575 (2008).

2007

  1. Е.В. Загайнова, М.В. Ширманова, В.А. Каменский, М.Ю. Кириллин, А.Г. Орлова, И.В. Балалаева, Б.Н. Хлебцов, А.М. Сергеев, ”Исследование контрастирующих свойств золотых наночастиц для метода ОКТ”, Российские Нанотехнологии, 2 (7-8), 135-143 (2007).
  2. M.Yu. Kirillin, E. Alarousu, T. Fabritius, R. Myllylä and A.V. Priezzhev “Visualization of paper structure by optical coherence tomography: Monte Carlo simulations and experimental study”, Journal of the European Optical Society - Rapid Publications, 2, 07031 (2007).

2006

  1. А.В. Быков, М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, Р. Мюллюля, “Моделирование сигнала пространственно-разрешенной рефлектометрии от трехслойной среды с сильным рассеянием применительно к проблеме определения содержания глюкозы в коже человека”, Квантовая Электроника, 36 (12), 1125-1130 (2006).
  2. Е.А. Сергеева, М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, «Распространение фемтосекундного импульса в рассеивающей среде: теоретический анализ и численное моделирование», Квантовая Электроника, 36 (11), 1023-1031 (2006).
  3. А.В. Быков, М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, «Монте-Карло моделирование сигналовоптического когерентного томографа и его доплеровского варианта от модельных биологических тканей», Оптика и спектроскопия, 101 (1), 37-43 (2006).
  4. М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, М.С. Федосеева, «Анализ вкладов различных кратностей рассеяния в сигнал оптического когерентного томографа от слоя крови методом Монте-Карло», Вестник МГУ.сер.3. Физика. Астрономия, No2, 36-40 (2006).
  5. M.Ю. Кириллин, И.В. Меглинский, А.В. Приезжев, «Влияние кратностей рассеяния на формирование сигнала в оптической низко-когерентной томографии сильно рассеивающих сред», Квантовая электроника, 36(3), 247-252 (2006).
  6. М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, Ю.Хаст, Р.Мюллюля, «Оптическое просветление бумаги в оптической когерентной томографии: Монте-Карло моделирование», Квантовая электроника, 36(2), 174-180 (2006).

2005

  1. А.В. Быков, М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, «Восстановление профиля скоростей потока суспензии, погруженного в светорассеивающую среду, по сигналу оптического когерентного доплеровского томографа (Монте-Карло моделирование)», Квантовая электроника, 35(11), 1079-1082 (2005).
  2. M.Yu. Kirillin, A.V. Priezzhev, V.V. Tuchin, R.K. Wang and R. Myllylä “Effect of red blood cell aggregation and sedimentation on optical coherence tomography signals from blood samples”, J. Phys. D: Appl. Phys. 38 , pp. 2582-2589 (2005)
  3. А.В. Быков, М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев. Монте-Карло моделирование сигнала оптического когерентного доплеровского томографа: влияние концентрации частиц в потоке на восстановленный профиль скоростей, Квантовая электроника, 35, 135-139 (2005).

2002

  1. М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, "Монте-Карло моделирование распространения лазерного пучка в плоском слое суспензии эритроцитов. Сравнение вкладов различных кратностей рассеяния в угловое распределение света", Квантовая электроника, 32(10), 883-887 (2002).